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海量數據處理利器 Roaring BitMap 原理介紹

來源: 責編: 時間:2024-06-20 15:23:29 122觀看
導讀一、引言在進行大數據開發時,我們可以使用布隆過濾器和Redis中的HyperLogLog來進行大數據的判重和數量統計,雖然這兩種方法節省內存空間并且效率很高,但是也存在一些誤差。如果需要100%準確的話,我們可以使用BitMap來存儲

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一、引言

在進行大數據開發時,我們可以使用布隆過濾器和Redis中的HyperLogLog來進行大數據的判重和數量統計,雖然這兩種方法節省內存空間并且效率很高,但是也存在一些誤差。如果需要100%準確的話,我們可以使用BitMap來存儲數據。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

BitMap 位圖索引數據結構被廣泛地應用于數據存儲和數據搜索中,但是對于存儲較為分散的數據時,BitMap會占用比較大的內存空間,因此我們更偏向于使用 Roaring BitMap稀疏位圖索引進行存儲。同時,Roaring BitMap廣泛應用于數據庫存儲和大數據引擎中,例如Hive,Spark,Doris,Kylin等。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

下文將分別介紹 BitMap 和 Roaring BitMap 的原理及其相關應用。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

二、BitMap原理

BitMap的基本思想就是用bit位來標記某個元素對應的value,而key就是這個元素。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

例如,在下圖中,是一個字節代表的8位,下標為1,2,4,6的bit位的值為1,則該字節表示{1,2,4,6}這幾個數。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

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在Java中,1個int占用4個字節,如果用int來存儲這四個數字的話,那么將需要4 * 4 = 16字節。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

BitMap可以用于快速排序,查找,及去重等操作。優點是占用內存少(相較于數組)和運算效率高,但是缺點也非常明顯,無法存儲重復的數據,并且在存儲較為稀疏的數據時,浪費存儲空間較多。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

三、Roaring BitMap 原理

3.1 存儲方式

為了解決BitMap存儲較為稀疏數據時,浪費存儲空間較多的問題,我們引入了稀疏位圖索引Roaring BitMap。Roaring BitMap 有較高的計算性能及壓縮效率。下面簡單介紹一下Roaring BitMap的基本原理。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

Roaring BitMap處理int型整數,將32位的int型整數分為高16位和低16位分別進行處理,高16位作為索引分片,而低16位用于存儲實際數據。其中每個索引對應一個數據桶(bucket),那么一共可以包含2^16 = 65536個數據塊。每個數據桶使用container容器來存儲低16位的部分,每個數據桶最多存儲2^16 = 65536個數據。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

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如上圖所示,高16位作為索引查找具體的數據塊,當前索引值為0,低16位作為value進行存儲。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

Roaring BitMap在進行數據存儲時,會先根據高16位找到對應的索引key(二分查找),低16位作為key對應的value,先通過key檢查對應的container容器,如果發現container不存在的話,就先創建一個key和對應的container,否則直接將低16位存儲到對應的container中。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

Roaring BitMap的精妙之處在于使用不同類型的container,接下來將對其進行介紹。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

3.2 container類型

1.ArrayContainerYYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

顧名思義,ArrayContainer直接采用數組來存儲低16位數據,沒有采用任何數據壓縮算法,適合存儲比較稀疏的數據,在Java中,使用short數組來存儲,并且占用的內存空間大小和數據量成線性關系。由于short為2字節,因此n個數據為2n字節。ArrayContainer采用二分查找定位有序數組中的元素,因此時間復雜度為O(logN)。ArrayContainer的最大數據量為4096, 4096 * 2b = 8kb。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

2.BitMapContainerYYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

BitMapContainer采用BitMap的原理,就是一個沒有經過壓縮處理的普通BitMap,適合存儲比較稠密的數據,在Java中使用Long數組存儲低16位數據,每一個bit位表示一個數字。由于每個container需要存儲2^16 = 65536個數據,如果通過BitMap進行存儲的話,需要使用2^16個bit進行存儲,即8kb的數據空間。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

可以從下圖中看出ArrayContainer和BitMapContainer的內存空間使用關系,當數據量小于4096時,使用ArrayContainer比較合適,當數據量大于等于4096時,使用BitMapContainer更佳。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

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因為BitMap直接使用位運算,所以BitMapContainer的時間復雜度為O(1)。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

3.RunContainerYYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

RunContainer采用Run-Length Encoding 行程長度編碼進行壓縮,適合存儲大量連續數據。Java中使用short數組進行存儲。連續bit位程度越高的話越節省存儲空間,最佳場景下(65536個數據全為1)只需要存儲4字節。最差場景為所有數據都不連續,所有存儲數據位置為奇數或者偶數,這種場景需要存儲128kb。由于采用二分查找算法定位元素,因此時間復雜度為O(logN)。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

行程長度編碼即的原理是對連續出現的數字進行壓縮,只記錄初始數字和后續連續數量。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

例如:[1,2,3,4,5,8,9,10]使用編碼后的數據為[1,4,8,2]。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

Java 里可以使用runOptinize()方法來對比RunContainer和其他兩個Container存儲空間大小,如果使用RunContainer存儲空間更佳則會進行轉化。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

根據上面三個Container類型我們可以得知如何進行選擇:YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

  1. Container默認使用ArrayContainer,當元素數量超過4096時,會由ArrayContainer轉換BitMapContainer。
  2. 當元素數量小于等于4096時,BitMapContainer會逆向轉換回ArrayContainer。
  3.  正常增刪元素不會使Container直接變成RunContainer,而需要用戶進行優化方法調用才會轉換為最節省空間的Container。

3.3 Roaring BitMap 相關源碼

介紹完Roaring BitMap的三種container類型以后,讓我們了解一下,Roaring BitMap的相關源碼。這里介紹一下Java中增加元素的源碼實現。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

public void add(final int x) {    final short hb = Util.highbits(x);    final int i = highLowContainer.getIndex(hb);    if (i >= 0) {      highLowContainer.setContainerAtIndex(i,          highLowContainer.getContainerAtIndex(i).add(Util.lowbits(x)));    } else {      final ArrayContainer newac = new ArrayContainer();      highLowContainer.insertNewKeyValueAt(-i - 1, hb, newac.add(Util.lowbits(x)));    }  }

Roaring BitMap首先獲取添加元素的高16位,然后再調用getIndex獲取高16位對應的索引,如果索引大于0,表示已經創建該索引對應的container,故直接添加相應的元素低16位即可;否則的話,說明該索引對應的container還沒有被創建,先創建對應的ArrayContainer,再進行元素添加。值得一提的是,在getIndex方法中,使用了二分查找來獲取索引值,所以時間復雜度為O(logn)。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

// 包含一個二分查找protected int getIndex(short x) {  // 在二分查找之前,我們先對常見情況優化。  if ((size == 0) || (keys[size - 1] == x)) {    return size - 1;  }  // 沒有碰到常見情況,我們只能遍歷這個列表。  return this.binarySearch(0, size, x);}

對于元素添加,三種Container提供了不同的實現方式,下面將分別介紹。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

1. ArrayContainerYYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

if (cardinality == 0 || (cardinality > 0          && toIntUnsigned(x) > toIntUnsigned(content[cardinality - 1]))) {    if (cardinality >= DEFAULT_MAX_SIZE) {      return toBitMapContainer().add(x);    }    if (cardinality >= this.content.length) {      increaseCapacity();    }    content[cardinality++] = x;  } else {    int loc = Util.unsignedBinarySearch(content, 0, cardinality, x);    if (loc < 0) {      // 當標簽中元素數量等于默認最大值時,把ArrayContainer轉換為BitMapContainer      if (cardinality >= DEFAULT_MAX_SIZE) {        return toBitMapContainer().add(x);      }      if (cardinality >= this.content.length) {        increaseCapacity();      }      System.arraycopy(content, -loc - 1, content, -loc, cardinality + loc + 1);      content[-loc - 1] = x;      ++cardinality;    }  }  return this;}

ArrayContainer把添加元素分成兩種場景,一種走二分查找,另外一種不走二分查找。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

第一種場景:不走二分查找。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

當基數為0或者值大于container中的最大值,可以直接添加,因為content數組是有序的,最后一個是最大值。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

當基數大于等于默認最大值4096時,ArrayContainer將轉換為BitMapContainer。如果基數大于content的數組長度的話,需要將content進行擴容。最后進行賦值即可。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

第二種場景:走二分查找。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

先通過二分查找找到對應的插入位置,如果返回loc大于等于0,說明存在,直接返回即可,如果小于0才進行后續插入。后續操作同上,當基數大于等于默認最大值4096時,ArrayContainer將轉換為BitMapContainer。如果基數大于content的數組長度的話,需要將content進行擴容。最后通過拷貝數組將元素插入到content數組中。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

2. BitMapContainerYYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

public Container add(final short i) {  final int x = Util.toIntUnsigned(i);  final long previous = BitMap[x / 64];  long newval = previous | (1L << x);   BitMap[x / 64] = newval;  if (USE_BRANCHLESS) {    cardinality += (previous ^ newval) >>> x;  } else if (previous != newval) {    ++cardinality;  }  return this;}

BitMap數組為BitMapContainer的存儲容器存放數據的內容,數據類型為long,在這里我們只需要找到x在BitMap中的位置,并且把相應的bit位置1即可。x/64就是找到對應long的舊值,1L<<x 就是把對應的bit位置為1,再跟舊值進行或操作,就可以得到新值,再將這個新值存回到bitmap數組即可。<="" span="">YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

3. RunContainerYYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

public Container add(short k) {     int index = unsignedInterleavedBinarySearch(valueslength, 0, nbrruns, k);  if (index >= 0) {    return this;// already there  }  index = -index - 2;  if (index >= 0) {    int offset = toIntUnsigned(k) - toIntUnsigned(getValue(index));    int le = toIntUnsigned(getLength(index));    if (offset <= le) {      return this;    }    if (offset == le + 1) {      // we may need to fuse      if (index + 1 < nbrruns) {        if (toIntUnsigned(getValue(index + 1)) == toIntUnsigned(k) + 1) {          // indeed fusion is needed          setLength(index,              (short) (getValue(index + 1) + getLength(index + 1) - getValue(index)));          recoverRoomAtIndex(index + 1);          return this;        }      }      incrementLength(index);      return this;    }    if (index + 1 < nbrruns) {      // we may need to fuse      if (toIntUnsigned(getValue(index + 1)) == toIntUnsigned(k) + 1) {        // indeed fusion is needed        setValue(index + 1, k);        setLength(index + 1, (short) (getLength(index + 1) + 1));        return this;      }    }  }  if (index == -1) {    // we may need to extend the first run    if (0 < nbrruns) {      if (getValue(0) == k + 1) {        incrementLength(0);        decrementValue(0);        return this;      }    }  }  makeRoomAtIndex(index + 1);  setValue(index + 1, k);  setLength(index + 1, (short) 0);  return this;}

RunContainer中的兩個數據結構,nbrruns表示有多少段行程,數據類型為int,valueslength數組表示所有的行程,數據類型為short。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

  1. 首先,使用二分查找+順序查找在valueslength數組中查找元素k的插入位置index。如果查找到的index結果大于等于0那就說明k是某個行程起始值,已經存在,直接返回。
  2. -index-2是為了指向前一個行程起始值的索引。
  3. 接下來是一些偏移量和索引值的判斷,主要是為了確認k是否落在上一個行程里,或者外面,如果落在上一個行程里,則直接返回,否則需要新建一個行程或者就近與一個行程混合并且將行程長度加1。

3.4 BitMap 和 Roaring BitMap 存儲情況對比

public static void count(Integer inputSize) {         RoaringBitMap BitMap = new RoaringBitMap();         BitMap.add(0L, inputSize);         //獲取BitMap個數        int cardinality = BitMap.getCardinality();         //獲取BitMap壓縮大小        int compressSizeIntBytes = BitMap.getSizeInBytes();         //刪除壓縮(移除行程編碼,將container退化為BitMapContainer 或 ArrayContainer)         BitMap.removeRunCompression();         //獲取BitMap不壓縮大小        int uncompressSizeIntBytes = BitMap.getSizeInBytes();         System.out.println("Roaring BitMap個數:" + cardinality);        System.out.println("最好情況,BitMap壓縮大小:" + compressSizeIntBytes / 1024 + "KB");        System.out.println("最壞情況,BitMap不壓縮大小:" + uncompressSizeIntBytes / 1024 / 1024 + "MB");         BitSet bitSet = new BitSet();        for (int i = 0; i < inputSize; i++) {            bitSet.set(i);        }        //獲取BitMap大小        int size = bitSet.size();         System.out.println("BitMap個數:" + bitSet.length());        System.out.println("BitMap大小:" + size / 8 / 1024 / 1024 + "MB");    }

上述代碼使用了Java內置的BitMap(BitSet) 和 Roaring BitMap進行存儲大小對比,輸出結果如下所示。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

  • Roaring BitMap個數:1000000000
  • 最好情況,BitMap壓縮大小:149KB
  • 最壞情況,BitMap不壓縮大小:119MB
  • Roaring BitMap個數:1000000000
  • BitMap大小:128MB

可以發現,Roaring BitMap的壓縮性能效果非常好,同等情況下,是BitMap占用內存的近一千分之一。在退化成BitMapContainer/arrayContainer之后也仍然比使用基本的BitMap存儲效果好一些。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

四、Roaring BitMap 使用

4.1 Java 中相關 API 使用

在Java中,Roaring BitMap提供了交并補差集等操作,如下代碼所示,列舉了Java中roaing BitMap的相關API使用方式。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

//添加單個數字public void add(final int x)//添加范圍數字public void add(final long rangeStart, final long rangeEnd)//移除數字public void remove(final int x)//遍歷RBMpublic void forEach(IntConsumer ic)//檢測是否包含public boolean contains(final int x)//獲取基數public int getCardinality()//位與,取兩個RBM的交集,當前RBM會被修改public void and(final RoaringBitMap x2)//同上,但是會返回一個新的RBM,不會修改原始的RBM,線程安全public static RoaringBitMap and(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)//位或,取兩個RBM的并集,當前RBM會被修改public void or(final RoaringBitMap x2)//同上,但是會返回一個新的RBM,不會修改原始的RBM,線程安全public static RoaringBitMap or(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)//異或,取兩個RBM的對稱差,當前RBM會被修改public void xor(final RoaringBitMap x2)//同上,但是會返回一個新的RBM,不會修改原始的RBM,線程安全public static RoaringBitMap xor(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)//取原始值和x2的差集,當前RBM會被修改public void andNot(final RoaringBitMap x2)//同上,但是會返回一個新的RBM,不會修改原始的RBM,線程安全public static RoaringBitMap andNot(final RoaringBitMap x1, final RoaringBitMap x2)//序列化public void serialize(DataOutput out) throws IOExceptionpublic void serialize(ByteBuffer buffer)//反序列化public void deserialize(DataInput in) throws IOExceptionpublic void deserialize(ByteBuffer bbf) throws IOException

對于序列化來說,Roaring BitMap官方定義了一套序列化規則,用來保證不同語言實現的兼容性。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

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Java中可以使用serialize方法進行序列化,deserialize方法進行反序列化。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

4.2 業務實際場景應用

Roaring BitMap可以用來構建大數據標簽,針對類型特征來創建對應的標簽。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

在我們的業務場景中,有很多需要基于人群標簽進行交并補集運算的場景,下面以一個場景為例,我們需要計算每天某個設備接口 在設備標簽A上的查詢成功率,因為設備標簽A中的設備不是所有都活躍在網的,所以我們需要將設備標簽A與每日日活人群標簽取交集,得到的交集大小才能用作成功率計算的分母,另外拿查詢成功的標簽人群做分子來進行計算即可,查詢時長耗時為1s。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

假如沒有使用標簽保存集合之前,我們需要在hive表中查詢出同時滿足當天在網的活躍用戶和設備A的用戶數量,查詢時長耗時在幾分鐘以上。兩種方式相比之下,使用Roaring BitMap查詢的效率更高。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

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五、總結

本文結合個人理解梳理了BitMap及Roaring BitMap的原理及使用,分別主要介紹了Roaring BitMap的存儲方式及三種container類型及Java中Roaring BitMap相關API使用,如有不足和優化建議,也歡迎大家批評指正。YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

參考資料:YYv28資訊網——每日最新資訊28at.com

  • Chambi S , Lemire D , Kaser O , et al.
    Better BitMap performance with Roaring 
    BitMaps[J]. Software—practice & Experience, 2016, 46(5):709-719.
  • https://RoaringBitMap.org/
  • https://github.com/RoaringBitMap/RoaringFormatSpec

本文鏈接:http://www.tebozhan.com/showinfo-26-95169-0.html海量數據處理利器 Roaring BitMap 原理介紹

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